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  郭衛(wèi)剛團(tuán)隊(duì)：揭示食管鱗狀細(xì)胞癌的預(yù)后建模和新興治療靶點(diǎn)
  
  2024-09-24 來(lái)源：轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)
  
  2024年9月20日，復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院郭衛(wèi)剛團(tuán)隊(duì)在期刊《Heliyon》上發(fā)表了題為“Prognostic Modeling and Emerging Therapeutic Targets Unveiled through Single-Cell Sequencing in Esophageal Squamous Cell Carcinoma”的研究論文。這項(xiàng)研究整合了單細(xì)胞測(cè)序和復(fù)雜的計(jì)算技術(shù)，以突出IGFBP2作為ESCC中一個(gè)有前途的生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。
  
  研究背景
  
  食管癌是一項(xiàng)重大的全球健康挑戰(zhàn)，2022年報(bào)告了約510,716例新病例，使其成為全球第11大普遍的癌癥，占當(dāng)年所有癌癥診斷的2.6%。2022年，約有445,129人死于食道癌，使其成為癌癥相關(guān)死亡的第7大原因，占所有癌癥死亡人數(shù)的4.6%。其中，鱗狀細(xì)胞癌（SCC）是主要亞型，占所有食管癌病例的85%。
  
  傳統(tǒng)的RNA-seq技術(shù)只能在聚集樣本水平上分析腫瘤，限制了對(duì)腫瘤細(xì)胞細(xì)胞多樣性和分子復(fù)雜性的探索。近年來(lái)，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的出現(xiàn)，提供了一種變革性的方法。該方法能夠在單個(gè)細(xì)胞水平上，表征不同細(xì)胞類型的表型和生物學(xué)行為，并有望確定潛在的治療靶點(diǎn)。
  
  在這項(xiàng)研究中，團(tuán)隊(duì)通過(guò)使用來(lái)自ESCC的單細(xì)胞RNA 測(cè)序（scRNA-seq）數(shù)據(jù)，分析癌細(xì)胞和非癌細(xì)胞類型，來(lái)鑒定癌細(xì)胞中獨(dú)特表達(dá)的基因。此外，團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一個(gè)帶有評(píng)分系統(tǒng)的基因預(yù)測(cè)模型，以提高在scRNA-seq數(shù)據(jù)集中，檢測(cè)單個(gè)癌細(xì)胞的準(zhǔn)確性，從而增強(qiáng)科學(xué)界分離癌細(xì)胞，進(jìn)行深入分析的能力。
  
  研究進(jìn)展
  
  IGFBP2的臨床意義
  
  與鄰近食管組織相比，IGFBP2在腫瘤樣本中顯著過(guò)表達(dá)，這與團(tuán)隊(duì)的scRNA-seq結(jié)果一致。為了確定IGFBP2的臨床意義，團(tuán)隊(duì)進(jìn)行了Kaplan-Meier生存分析。結(jié)果顯示，與低表達(dá)水平的患者相比，表現(xiàn)出高IGFBP2染色強(qiáng)度的患者與較差的預(yù)后相關(guān)。此外，多變量Cox分析顯示，在考慮年齡、性別和分期后，IGFBP2的表達(dá)仍然是OS的獨(dú)立預(yù)后因素。
  
  IGFBP2的臨床意義。
  
  與IGFBP2相關(guān)的免疫特性
  
  團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，IGFBP2表達(dá)與許多腫瘤相關(guān)免疫細(xì)胞（尤其是CD8+ T細(xì)胞）的浸潤(rùn)之間，存在顯著的負(fù)相關(guān)。此外，團(tuán)隊(duì)觀察到IGFBP2表達(dá)升高與多種免疫調(diào)節(jié)劑的下調(diào)有關(guān)，包括抗原呈遞、共刺激、T細(xì)胞效應(yīng)功能和免疫檢查點(diǎn)。這表明IGFBP2在ESCC中具有潛在的免疫抑制作用。
  
  IGFBP2的免疫相關(guān)特征。
  
  研究結(jié)論
  
  這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)了幾個(gè)在傳統(tǒng)批量數(shù)據(jù)分析中，不容易檢測(cè)到的腫瘤相關(guān)基因。這一成就在很大程度上歸功于scRNA-seq技術(shù)的利用。鑒于癌細(xì)胞通常只占這種混合物的一小部分，因此在使用大量RNA測(cè)序時(shí)，腫瘤特異性標(biāo)志物可能會(huì)因其低豐度而黯然失色。相比之下，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)為深入研究單個(gè)細(xì)胞類型的表達(dá)模式提供了強(qiáng)大的工具，這使得科學(xué)界能夠揭示錯(cuò)綜復(fù)雜的細(xì)胞異質(zhì)性和新的治療靶點(diǎn)，否則，這些靶點(diǎn)將無(wú)法通過(guò)批量分析獲得。用特定藥物靶向這些基因，可以通過(guò)較大限度地減少對(duì)非惡性細(xì)胞的毒性影響，來(lái)提供更安全、更有效的治療策略。這強(qiáng)調(diào)了了解ESCC分子景觀，對(duì)于開(kāi)發(fā)靶向治療和改善患者預(yù)后的重要性。
  
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