Cell子刊:用PROTAC治療艾滋病
HIV-1、HIV-2和SIV(猴免疫缺陷病毒)的Nef基因編碼獨特的膜相關(guān)蛋白,在病毒復(fù)制、持久性和艾滋病進(jìn)展中發(fā)揮關(guān)鍵作用。HIV-1病毒的Nef在感染后很快高水平表達(dá),并與多種宿主細(xì)胞蛋白相互作用,以增強(qiáng)病毒感染性和促進(jìn)免疫逃逸。Nef還結(jié)合并激活非受體蛋白酪氨酸激酶和肌動蛋白細(xì)胞骨架的調(diào)節(jié)因子,以促進(jìn)病毒轉(zhuǎn)錄和釋放。
在非人類靈長類動物中的研究證明了Nef對于艾滋病的感染和發(fā)展至關(guān)重要。Nef缺陷的SIV在猴子體內(nèi)復(fù)制不良,導(dǎo)致低病毒載量和延遲發(fā)病。而感染了Nef缺陷的HIV-1的人在沒有抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療的情況下仍病毒載量較低。這些發(fā)現(xiàn)確立了Nef在HIV-1病毒感染和艾滋病發(fā)病中的核心作用,并支持開發(fā)Nef拮抗劑作為一種新的艾滋病療法。
2024年3月19日,匹茨堡大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員在 Cell 子刊 Cell Chemical Biology 上發(fā)表了題為:PROTAC-mediated degradation of HIV-1 Nef efficiently restores cell-surface CD4 and MHC-I expression and blocks HIV-1 replication 的研究論文。
該研究開發(fā)了一種靶向HIV病毒的Nef蛋白的PROTAC系統(tǒng),將Nef結(jié)合化合物與E3泛素連接酶配體偶聯(lián),從而在細(xì)胞內(nèi)引發(fā)Nef降解,抑制HIV-1復(fù)制,還能有效挽救T細(xì)胞中Nef介導(dǎo)的MHC-I和CD4下調(diào)。
PROTAC技術(shù)是近年來蓬勃發(fā)展的新興蛋白質(zhì)降解策略。PROTAC的基本原理是使用雙功能小分子,通過泛素-蛋白酶體系統(tǒng)誘導(dǎo)靶蛋白的泛素化,進(jìn)而實現(xiàn)靶蛋白降解。自2019年第一個靶向雄激素受體PROTAC分子ARV-110進(jìn)入臨床研究以來,PROTAC領(lǐng)域進(jìn)入快速發(fā)展期。
在此前的研究中,該團(tuán)隊合成了一系列羥基吡唑化合物,通過表面等離子體共振(SPR)與Nef緊密結(jié)合,并在體外對多種Nef功能具有活性。然而,Nef缺乏活性位點,由于體外Nef結(jié)合親和力與細(xì)胞系統(tǒng)抗逆轉(zhuǎn)錄病毒活性之間缺乏相關(guān)性,使得藥物化學(xué)優(yōu)化變得復(fù)雜。此外,這些基于占位的Nef抑制劑在細(xì)胞表面MHC-I挽救方面表現(xiàn)出相對較低的效果。
在這項研究中,研究團(tuán)隊通過將現(xiàn)有的Nef結(jié)合化合物改為雙價蛋白靶向降解嵌合體(PROTAC)來解決上述限制。PROTAC的一個主要優(yōu)點是它只需要目標(biāo)蛋白的選擇性結(jié)合劑,而不需要功能性抑制劑。研究團(tuán)隊合成了一個Nef導(dǎo)向的PROTAC候選文庫,將現(xiàn)有的羥基吡唑Nef結(jié)合化合物連接到E3泛素連接酶CRBN和VHL上。通過基于細(xì)胞的正交實驗來檢測對Nef泛素化、降解和功能,從中發(fā)現(xiàn)了有前途的Nef導(dǎo)向的PROTAC,它們靶向CRBN E3泛素連接酶通路。這些化合物誘導(dǎo)了Nef降解,并有效逆轉(zhuǎn)Nef介導(dǎo)的MHC-I和CD4下調(diào)。而靶向降解可逆轉(zhuǎn)HIV-1 Nef功能,并可能有助于恢復(fù)體內(nèi)針對HIV-1儲存細(xì)胞的適應(yīng)性免疫反應(yīng)。
Nef PROTAC還在HIV感染原代細(xì)胞中表現(xiàn)出強(qiáng)大的抗逆轉(zhuǎn)錄病毒活性,支持進(jìn)一步開發(fā)用于在體內(nèi)減少HIV-1病毒儲庫。
更重要的是,這項研究鼓勵了開發(fā)靶向病毒蛋白質(zhì)的PROTAC,這些病毒蛋白質(zhì)本質(zhì)上難以通過傳統(tǒng)的基于占位的抑制劑進(jìn)行靶向。
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