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科學(xué)家找到白血病全新遺傳致病因子!
2024-01-16
來(lái)源:中國(guó)科學(xué)報(bào)
白血病是一種血液系統(tǒng)的惡性腫瘤,俗稱(chēng)“血癌”。白血病的發(fā)生與多種因素有關(guān),其中包括家族遺傳因素、化學(xué)因素、物理因素、病毒感染等,探索白血病的發(fā)病機(jī)制,有助于為白血病早篩和干預(yù)帶來(lái)新策略。
北京時(shí)間1月12日晚23時(shí),深圳理工大學(xué)(籌)藥學(xué)院教授、中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院醫(yī)藥所癌癥免疫研究中心趙佳偉聯(lián)合哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬波士頓兒童醫(yī)院杰出副教授、麻省理工學(xué)院布羅德研究所研究員Vijay Sankaran團(tuán)隊(duì)在《細(xì)胞》發(fā)表新研究。研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用英國(guó)生物樣本數(shù)據(jù)庫(kù)(UK Biobank),對(duì)超46萬(wàn)個(gè)病人樣本進(jìn)行了遺傳學(xué)分析,找到了一個(gè)全新的髓系惡性血液腫瘤家族致病風(fēng)險(xiǎn)因子,有望為潛在的早發(fā)性白血病早期篩查與干預(yù)提供新思路。
“這項(xiàng)工作確定了一種新的基因——CTR9,該基因攜帶遺傳突變,使血液腫瘤易感性增加10倍,同時(shí)我們也定義了這種情況是如何發(fā)生的。這些發(fā)現(xiàn)是很重要的,因?yàn)槲覀儼l(fā)現(xiàn)了關(guān)于這一基因的調(diào)控機(jī)制,可以使血液腫瘤預(yù)防成為可能?!闭撐墓餐ㄓ嵶髡遃ijay Sankaran說(shuō)道。
“后裔射日”的故事寓意CTR9的部分丟失可以有效提高人造血干細(xì)胞的數(shù)量,但其基本的生物學(xué)功能需要它存在于細(xì)胞中以保持細(xì)胞功能 賈月萌供圖
該研究中,深理工藥學(xué)院教授、深圳先進(jìn)院醫(yī)藥所癌癥免疫研究中心趙佳偉、原哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士后Liam Cato為本文共同作者,趙佳偉、Vijay Sankaran為本文共同通訊作者。
“年輕”的癌癥
與其他大多數(shù)惡性腫瘤不同,白血病是一種“年輕”的惡性腫瘤,平均發(fā)病年齡與其他實(shí)體惡性腫瘤相比顯著偏低。根據(jù)《國(guó)家兒童腫瘤監(jiān)測(cè)年報(bào)(2022)》數(shù)據(jù)顯示,白血病仍是兒童高發(fā)腫瘤。
急性白血病具有發(fā)病急、致死率高、難以完全治愈等特點(diǎn)。隨著白血病細(xì)胞在骨髓內(nèi)無(wú)限制增和積聚,會(huì)逐漸影響正常的骨髓造血功能,使紅細(xì)胞、白細(xì)胞、血小板等無(wú)法正常產(chǎn)生和發(fā)揮作用,從而引起發(fā)熱、感染、出血、貧血等一系列癥狀,導(dǎo)致多器官功能障礙,甚至死亡。
“目前,治愈白血病的方式高度依賴(lài)于健康造血干細(xì)胞的移植,而非親屬間的造血干細(xì)胞配型通常需要經(jīng)歷非常漫長(zhǎng)的等待,耽誤了病人有效的治療時(shí)間。”趙佳偉介紹。
對(duì)此,研究團(tuán)隊(duì)提出了一個(gè)設(shè)想,一些先天性的家族可遺傳風(fēng)險(xiǎn)因子可能在白血病發(fā)生機(jī)制中發(fā)揮重要作用?!氨M管近幾十年來(lái),科學(xué)家們對(duì)白血病等血液腫瘤的發(fā)生和相關(guān)致病機(jī)理已有了較為完整的研究,但對(duì)血液腫瘤中遺傳因素作用的理解仍十分有限?!壁w佳偉說(shuō)。
高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展和完善,為種群遺傳學(xué)研究帶來(lái)更多可能性。2020年底,趙佳偉等人運(yùn)用英國(guó)生物樣本數(shù)據(jù)庫(kù)(UK Biobank),對(duì)超46萬(wàn)個(gè)病人的全基因組遺傳信息進(jìn)行分析,并從中找到與家族關(guān)聯(lián)性很高的可遺傳風(fēng)險(xiǎn)因子,研究團(tuán)隊(duì)鎖定了一個(gè)此前尚未被報(bào)道的、可以顯著提升髓系白血病發(fā)病率的基因——CTR9。
解碼46萬(wàn)個(gè)樣本,找到全新遺傳致病因子
想要在超46萬(wàn)個(gè)病人樣本中,發(fā)現(xiàn)全新的白血病遺傳致病因子,并非易事。人的基因組包括了超30億個(gè)堿基對(duì),將近三萬(wàn)個(gè)基因,而要在龐大的基因組中找到基因突變體更猶如“大海撈針”。
“整個(gè)研究過(guò)程,可以分為尋找和驗(yàn)證兩個(gè)重要步驟。一是找到相關(guān)的基因突變體,二是驗(yàn)證該突變體會(huì)導(dǎo)致白血病發(fā)生?!?/span>
“提出設(shè)想后,我們首先要解決的就是statistical power(統(tǒng)計(jì)功效)的問(wèn)題,驗(yàn)證在統(tǒng)計(jì)學(xué)上能否承載如此大樣本的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)?!壁w佳偉介紹,在解決了統(tǒng)計(jì)學(xué)方面難題后,研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)全基因組測(cè)序找到的罕見(jiàn)突變體進(jìn)行了罕見(jiàn)突變體相關(guān)聯(lián)研究,鎖定了髓系惡性血液腫瘤易感性的重要家族風(fēng)險(xiǎn)因素——CTR9突變體。
造血干細(xì)胞的擴(kuò)增是白血病的初期表現(xiàn),在過(guò)度擴(kuò)增后,部分造血干細(xì)胞可能會(huì)逐漸失去自我調(diào)控和分化成正常血細(xì)胞的能力。研究團(tuán)隊(duì)利用人源造血干細(xì)胞并以免疫缺陷小鼠為模型,驗(yàn)證了這一風(fēng)險(xiǎn)因子對(duì)造血干細(xì)胞的影響,循序漸進(jìn)地解開(kāi)了這一高風(fēng)險(xiǎn)致病因子導(dǎo)致白血病的生物學(xué)機(jī)制。
在后續(xù)兩年多的驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)中,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)當(dāng)且僅當(dāng)CTR9部分缺失時(shí),人長(zhǎng)期和短期造血干細(xì)胞具有顯著性的擴(kuò)增,當(dāng)CTR9完全缺失時(shí),造血干細(xì)胞無(wú)法長(zhǎng)期維持穩(wěn)態(tài)。值得注意的是,相比其他較為常見(jiàn)的遺傳因素,該基因突變體的白血病易感性增加了10倍。
另外,融合基因是白血病診斷分型、預(yù)后分層、靶向治療及微小殘留病監(jiān)測(cè)的主要指標(biāo),目前已有數(shù)百種融合基因被納入世界衛(wèi)生組織白血病診斷分類(lèi)標(biāo)準(zhǔn)中?!澳芤鸢籽〉奶禺愋匀诤匣蛴泻芏啵覀儼l(fā)現(xiàn)的這一CTR9基因突變體正屬于能夠?qū)︱?qū)動(dòng)白血病發(fā)生的一類(lèi)融合基因產(chǎn)生影響的基因?!壁w佳偉說(shuō)道。
“該項(xiàng)工作具有高度性,研究團(tuán)隊(duì)利用了一系列令人印象深刻的尖端基因組、表觀基因組技的新穎技術(shù)及嚴(yán)格的分子生物學(xué)分析來(lái)剖析這一全新致病因子在人類(lèi)造血干細(xì)胞的自我更新調(diào)節(jié)和白血病易感性中的功能?!?審稿人對(duì)該成果評(píng)價(jià)道。
探索白血病早篩策略
對(duì)所有疾病來(lái)說(shuō),預(yù)防比治療更重要,這在惡性血液腫瘤這類(lèi)致死率極高的疾病中更為關(guān)鍵。提升診斷水平無(wú)疑是有效對(duì)抗癌癥的核心所在。
這項(xiàng)研究開(kāi)創(chuàng)性地揭露了一個(gè)尚未被報(bào)道的可以顯著影響白血病發(fā)生率的家族性遺傳因子,通過(guò)對(duì)這一風(fēng)險(xiǎn)因子的早期篩查,有望為潛在的白血病高風(fēng)險(xiǎn)者提前進(jìn)行針對(duì)性的干預(yù)。
另一位審稿人在評(píng)價(jià)中指出,“這是一項(xiàng)非常有趣的研究,其臨床意義和分子機(jī)制都具有廣泛的吸引力?!?/span>
“遺傳學(xué)是復(fù)雜且難以預(yù)測(cè)的,人種的差異性對(duì)某些疾病的影響可能遠(yuǎn)超我們的想象。在基于高通量測(cè)序技術(shù)下的種群遺傳學(xué)研究領(lǐng)域,我國(guó)與發(fā)達(dá)國(guó)家仍存在一定差距,我國(guó)在病人遺傳信息儲(chǔ)備量方面存在嚴(yán)重不足。”趙佳偉說(shuō)道。
趙佳偉表示,依托在國(guó)外的科研平臺(tái)開(kāi)展了較好的工作基礎(chǔ),未來(lái)將進(jìn)一步深入探究造血干細(xì)胞穩(wěn)態(tài)機(jī)制,以及造血干細(xì)胞向白血病轉(zhuǎn)化機(jī)制方面深入探究,為白血病治療策略帶來(lái)更多思路。同時(shí),探索建立專(zhuān)屬于中國(guó)的種群遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),更有助于找到適合我國(guó)病人的治療靶點(diǎn),并探索出專(zhuān)屬于中國(guó)人的藥物開(kāi)發(fā)途徑。
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